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SARS-CoV-2:B.1.1.529 变种有多严重,现在命名为 Omicron

B.1.1.529 变种于 24 日首次从南非报告给世卫组织th 2021 年 1.1.529 月。第一个已知确诊的 B.9 感染来自 XNUMX 日收集的样本。th 2021 年 11 月1. 另一个来源2 表明该变体首先在 11 日收集的样本中检测到th 2021 年 14 月在博茨瓦纳和 XNUMXth 2021 年 19 月在南非。 从那时起,南非几乎所有省份的 COVID-27 病例数都急剧增加。 正如 XNUMXth 2021 年 XNUMX 月,比利时、香港、以色列、英国也报告了该变种的新病例3,德国,意大利和捷克共和国,它们的起源都与旅行有关。  

感谢南非当局及时与全球科学界沟通和分享相关信息,使世卫组织专家组能够在 26th 2021 年 1.1.529 月,并迅速将此变体指定为关注变体 (VOC)。 事情的严重性可以从 B.24 仅在两天前于 XNUMXth 2021年26月XNUMX日被指定为VOC之前th 2021 年 XNUMX 月,但没有首先被指定为调查中的变种 (VOI)。  

表:截至 2 年 26 月 2021 日的 SARS-CoV-XNUMX 关注变种 (VOC) 

世卫组织标签  血统   首次发现的国家(社区)  首次检测到的年份和月份  
阿尔法  B.1.1.7  英国  2020 年 9 月  
测试  B.1.351  南非  2020 年 9 月  
伽玛  P.1  巴西  2020 年 12 月  
Delta  B.1.617.2  印度  2020 年 12 月 
奥米克  B.1.1.529 多个国家/地区,2021 年 XNUMX 月 监控中的变体 (VUM):24 年 2021 月 XNUMX 日  关注的变体 (VOC):26 年 2021 月 XNUMX 日 
(来源:世卫组织4, 追踪 SARS-CoV-2 变种)  

将 B.1.1.529 指定为关注变体 (VOC) 的紧迫性是有道理的,因为发现该变体是迄今为止最多样化的 SARS-CoV-2 变体。 与最初在中国武汉发现的 SARS-CoV-2 病毒相比,它在刺突蛋白中有多达 30 个氨基酸变化、3 个小缺失和 1 个小插入。 在这些变化中,有 15 个位于受体结合域 (RBD),这是病毒的一部分,允许它进入人体细胞,导致感染。 该变体在其他基因组区域也有许多变化和缺失2. 突变如此广泛,以至于人们可以称其为新菌株,而不是变体。 令人难以置信的大量尖峰突变意味着逃避已知抗体的可能性增加,这使得该变体成为严重关注的问题5.  

更改为新的变种对于冠状病毒来说很常见。 由于缺乏聚合酶校对核酸酶活性,冠状病毒的基因组以极高的速度发生突变一直是自然而然的事情。 传播越多,复制错误就越多,因此在基因组中积累了更多的突变,导致新的变异。 在最近的历史中,人类冠状病毒一直在积累突变以创造新的变种。 自 1966 年记录第一集以来,有几种导致流行病的变种6. 但是,为什么在一次爆发中发生如此广泛的突变? 可能是因为 B.1.1.529 变异是在免疫功能低下的人(可能是未经治疗的 HIV/AIDS 患者)的慢性感染期间进化而来的7.  

无论广泛突变的原因是什么,如果它在南非传播的速度有任何迹象,那么这种变体的进化可能对目前使用的现有疫苗的免疫力、传染性和毒力以及有效性产生巨大影响。  

无论现有疫苗是否仍能有效对抗这种新变种,或者是否会出现更多疫苗突破性感染的情况,目前几乎没有可用的数据得出任何结论。 然而,在最近的一项研究中,刺突蛋白中有 20 个突变的合成变体显示出几乎完全摆脱了抗体7. 这表明具有更多突变的新变体 B.1.1.529 可能显示出显着降低的抗体中和作用。 然而,尽管目前的数据不足以得出任何可靠的估计,但新的变种似乎确实更容易传播,因为它在南非取代了 Delta 变种的速度很快。 同样,现阶段无法评论症状的严重程度。  

鉴于过去几周欧洲已经出现了异常多的 COVID 19 病例(由于具有高度传染性的 delta 变体),而且发生的速度很快 奥米克 (B.1.1.529) 变种最近在南非蔓延,取代了 delta 变种,包括英国、德国和意大利在内的多个欧洲国家对来自南非和来自博茨瓦纳、马拉维、莫桑比克、赞比亚和安哥拉。 由于担心最坏的情况,以色列将禁止所有国家的游客入境。  

世界在开发和管理 COVID-19 疫苗方面投入了大量资金,以保护人们免受大流行的侵害。 科学家和权威人士最关心的问题是,辉瑞-BioNTech、牛津-阿斯利康、Moderna、强生等主要 COVID-19 疫苗是否仍能有效对抗 Omicron(B.1.1.529)变种. 这是由于南非报告了突破性感染这一事实。 两宗香港病例也已接种疫苗9

开发“泛冠状病毒”疫苗10 (多价疫苗平台11) 似乎是当时的需要。 但是,更快地,有可能快速制造覆盖突变的 mRNA 和 DNA 疫苗的加强剂量。 此外,最近批准的 抗病毒药 (默克的 Molnupiravir 和辉瑞的 Paxlovid)应该能派上用场,保护人们免于住院和死亡。   

 *** 

参考文献:  

  1. WHO 2021. 新闻 – Omicron 的分类 (B.1.1.529):SARS-CoV-2 关注的变体。 26 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在线获取: https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  
  1. 欧洲疾病预防和控制中心。 SARSCoV-2 出现和传播的影响 B.1.1。 529 关注变体 (Omicron),适用于欧盟/欧洲经济区。 26 年 2021 月 2021 日。ECDC:斯德哥尔摩; XNUMX. 可在网上获得 https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  
  1. 英国政府 2021 年。新闻稿 – 英国发现首例 Omicron 变种病例。发布于 27 年 2021 月 XNUMX 日。可在 https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   
  1. 世卫组织,2021 年。追踪 SARS-CoV-2 变种。 可在线获取 https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 
  1. GitHub,2021 年。Thomas Peacock:与南部非洲相关的 B.1.1 后代,具有大量 Spike 突变 #343。 可在线获取 https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 
  1. 普拉萨德 U.2021。 冠状病毒的变种:我们目前所知道的。 科学的欧洲人。 12 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在线获取: https://www.scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 
  1. GAVI 2021. 疫苗工作——我们对新的 B.1.1.529 冠状病毒变种了解多少,我们应该担心吗? 可在 https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 
  1. Schmidt, F.、Weisblum, Y.、Rutkowska, M. 等。 SARS-CoV-2多克隆中和抗体逃逸的高遗传屏障。 自然 (2021)。 https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 
  1. 严重变异的冠状病毒变种使科学家们保持警惕。 自然 N新闻。 27 年 2021 月 XNUMX 日更新。DOIhttps://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  
  1. Soni R. 2021. “泛冠状病毒”疫苗:RNA 聚合酶成为疫苗靶点。 科学的欧洲人。 16 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在 https://www.scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  
  1. NIH 2021. 新闻稿——NIAID 颁发新奖项以资助“泛冠状病毒”疫苗。 28 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在 https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

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乌梅什·普拉萨德(Umesh Prasad)
乌梅什·普拉萨德(Umesh Prasad)
科学记者| 《科学欧洲》杂志创始人编辑

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