SARS-CoV-2:B.1.1.529 变种有多严重,现在命名为 Omicron

B.1.1.529变异株于2021年11月24日首次在南非向世卫组织报告。首例已知的确诊B.1.1.529感染病例来自2021年11月9日采集的样本<sup>1</sup>。另有资料<sup>2 </sup>显示,该变异株最早于2021年11月11日在博茨瓦纳以及2021年11月14日在南非采集的样本中被检测到。此后,南非几乎所有省份的COVID-19病例数量都急剧增加。截至2021年11月27日,比利时、香港、以色列、英国<sup> 3</sup> 、德国、意大利和捷克共和国也报告了该变异株的新病例,这些病例均与旅行有关。

感谢南非当局迅速与全球科学界沟通并分享相关信息,使得世卫组织专家组得以在2021年11月26日召开会议,并迅速将该变异株列为关注变异株(VOC)。事态的严重性可见一斑:B.1.1.529 仅在两天前的2021年11月24日被列为监测变异株(VUM),随后又在2021年11月26日被列为关注变异株(VOC ),而此前并未被列为调查变异株(VOI)。

表:截至 2 年 26 月 2021 日的 SARS-CoV-XNUMX 关注变种 (VOC) 

世卫组织标签  血统   首次发现的国家(社区)  首次检测到的年份和月份  
阿尔法  B.1.1.7  英国  2020 年 9 月  
测试  B.1.351  南非  2020 年 9 月  
伽玛  P.1  巴西  2020 年 12 月  
Delta  B.1.617.2  印度  2020 年 12 月 
奥米克  B.1.1.529 多个国家/地区,2021 年 XNUMX 月 监控中的变体 (VUM):24 年 2021 月 XNUMX 日  关注的变体 (VOC):26 年 2021 月 XNUMX 日 
(来源:世卫组织4, 追踪 SARS-CoV-2 变种)  

将B.1.1.529指定为关注变异株(VOC)的紧迫性在于,该变异株是迄今为止发现的SARS-CoV-2变异株中差异最大的。与最初在中国武汉发现的SARS-CoV-2病毒相比,该变异株的刺突蛋白中存在多达30个氨基酸变化、3个小片段缺失和1个小片段插入。其中15个变化位于受体结合域(RBD)内,RBD是病毒进入人体细胞并导致感染的关键区域。该变异株在其他基因组区域也存在一些变化和缺失<sup> 2</sup>。这些突变如此广泛,以至于可以将其称为一种新的毒株,而非变异株。刺突蛋白突变数量之多意味着病毒逃避已知抗体的可能性大大增加,这使得该变异株成为一个令人严重担忧的问题<sup> 5</sup>。

冠状病毒变异成新变种是常见现象。由于其聚合酶缺乏校正核酸酶活性,冠状病毒基因组的突变率极高,这早已是其特性;传播越多,复制错误就越多,基因组中积累的突变也就越多,最终导致新变种的产生。近年来,人类冠状病毒一直在积累突变,产生新的变种。自1966年首次记录到疫情以来,已有多种变种引发了流行<sup> 6</sup>。但是,为什么会在一次爆发中出现如此广泛的突变呢?或许是因为B.1.1.529变种是在免疫功能低下者(可能是未经治疗的HIV/AIDS患者)的慢性感染过程中进化而来的<sup> 7 </sup>。

无论广泛突变的原因是什么,如果它在南非传播的速度有任何迹象,那么这种变体的进化可能对目前使用的现有疫苗的免疫力、传染性和毒力以及有效性产生巨大影响。  

目前尚无足够数据得出任何结论,现有疫苗是否仍能有效对抗这种新变种,以及是否会出现更多疫苗突破性感染病例。然而,最近一项研究表明,一种在刺突蛋白中存在20个突变的合成变种几乎完全逃避了抗体攻击<sup> 7</sup>。这表明,突变数量远超以往的新型变种B.1.1.529可能显著降低抗体的中和能力。不过,从其在南非迅速取代Delta变种的速度来看,这种新变种似乎更具传播性,但目前的数据尚不足以做出可靠的估计。同样,现阶段也无法对症状的严重程度做出评论。

鉴于过去几周欧洲新冠肺炎病例数量异常激增(主要由高传染性的δ变异株引起),且奥密克戎(B.1.1.529)变异株近期在南非迅速传播并取代δ变异株,包括英国、德国和意大利在内的多个欧洲国家已对来自南非以及博茨瓦纳、马拉维、莫桑比克、赞比亚和安哥拉等邻国的旅客实施旅行限制。出于对疫情的担忧,以色列计划禁止所有国家的旅客入境。

世界各国投入巨资研发和接种新冠疫苗,以保护民众免受疫情侵害。科学家和相关部门最关心的问题是,辉瑞-BioNTech、牛津-阿斯利康、Moderna、强生等主流新冠疫苗是否仍能有效对抗Omicron(B.1.1.529)变种病毒。南非报告的突破性感染病例加剧了这一担忧。香港的两例病例也曾接种过疫苗。

研发“泛冠状病毒”疫苗(多价疫苗平台)似乎是当务之急。但更快捷的方法是快速生产覆盖所有变异株的mRNA和DNA疫苗的加强剂。此外,近期获批的抗病毒药物(默克公司的莫努匹拉韦和辉瑞公司的帕克洛维)也应有助于降低住院率和死亡率。

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参考文献:  

  1. WHO 2021. 新闻 – Omicron 的分类 (B.1.1.529):SARS-CoV-2 关注的变体。 26 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在线获取: https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  
  1. 欧洲疾病预防和控制中心。 SARSCoV-2 出现和传播的影响 B.1.1。 529 关注变体 (Omicron),适用于欧盟/欧洲经济区。 26 年 2021 月 2021 日。ECDC:斯德哥尔摩; XNUMX. 可在网上获得 https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  
  1. 英国政府 2021 年。新闻稿 – 英国发现首例 Omicron 变种病例。发布于 27 年 2021 月 XNUMX 日。可在 https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   
  1. 世卫组织,2021 年。追踪 SARS-CoV-2 变种。 可在线获取 https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 
  1. GitHub,2021 年。Thomas Peacock:与南部非洲相关的 B.1.1 后代,具有大量 Spike 突变 #343。 可在线获取 https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 
  1. 普拉萨德 U.2021。 冠状病毒的变种:我们目前所知道的。 科学的欧洲人。 12 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在线获取: http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 
  1. GAVI 2021. 疫苗工作——我们对新的 B.1.1.529 冠状病毒变种了解多少,我们应该担心吗? 可在 https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 
  1. Schmidt, F.、Weisblum, Y.、Rutkowska, M. 等。 SARS-CoV-2多克隆中和抗体逃逸的高遗传屏障。 自然 (2021)。 https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 
  1. 严重变异的冠状病毒变种使科学家们保持警惕。 自然 N新闻。 27 年 2021 月 XNUMX 日更新。DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  
  1. Soni R. 2021. “泛冠状病毒”疫苗:RNA 聚合酶成为疫苗靶点。 科学的欧洲人。 16 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在 http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  
  1. NIH 2021. 新闻稿——NIAID 颁发新奖项以资助“泛冠状病毒”疫苗。 28 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在 https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

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