2022 年宣布的袋狼去灭绝项目在生成最高质量的古代基因组、有袋动物基因组编辑和有袋动物新型辅助生殖技术 (ART) 方面取得了新的里程碑。这些舞蹈ments 不仅将支持塔斯马尼亚虎的复活(由于人类的掠夺,它们自 1936 年以来已经灭绝),而且还将帮助保护濒临灭绝的物种。袋狼的复活和回归将恢复当地生态系统的健康运作。新获得的能力还将有助于保护极度濒危的物种。
新重建的袋狼基因组长度约为 3 亿个碱基,是迄今为止所有物种中最完整、最连续的古代基因组。它组装到染色体水平,估计准确率 >99.9%。它包括难以组装的重复特征,例如着丝粒和端粒,即使对于现存物种来说,这些特征也难以重建。基因组只有 45 个缺口,未来几个月将通过额外的测序工作填补这些缺口。
大多数古代标本仅保留了短 DNA 序列,几乎没有 RNA,这是由于生物体死亡后会降解。新的袋狼基因组在长 DNA 序列和 RNA 的保存方面非常出色。RNA 降解速度非常快,因此在历史样本中很少能保存 RNA。在这种情况下,研究小组成功地从 110 年前样本的保存软组织中分离出长 RNA 分子。这一点很重要,因为 RNA 的表达在组织中有所不同,因此组织中 RNA 的存在可以让我们了解组织正常运作所需的活性基因。新的 RNA 层使由 DNA 构建的袋狼基因组在复活灭绝物种方面更有用。
重建袋狼基因组后,下一步就是识别袋狼独特颌骨和头骨形态的核心特征背后的基因。为了确定这一点,研究小组将袋狼基因组与具有相似颅面形状的狼和狗的基因组进行了比较,并确定了基因组中称为“袋狼狼加速区域”(TWAR)的区域,后来发现这些区域推动了哺乳动物头骨形状的进化。
在确认 TWAR 负责颅面形态后,研究小组对一种肥尾袋鼩的细胞系进行了超过 300 个相同的基因编辑,肥尾袋鼩是袋狼现存最接近的亲属,并将成为袋狼胚胎的未来替代品。
接下来是开发辅助生殖技术 (ART),用于替代袋狼的袋狼物种。在袋狼复活项目之前,几乎没有任何有袋动物使用辅助生殖技术。这项研究现已开发出一种关键技术,可同时诱导袋狼体内许多卵子的控制排卵。这些卵子可用于创建新胚胎,以承载编辑后的袋狼基因组。研究人员还能够取出受精的单细胞胚胎,并在怀孕中期将其放入人工子宫装置中培养。新的辅助生殖技术可应用于有袋动物家族,用于袋狼复活以及提高濒危有袋动物物种的繁殖能力。
让袋狼复活并返回塔斯马尼亚本土将恢复当地生态系统的健康运作。新获得的能力还将有助于保护极度濒危的物种。
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参考文献:
- 墨尔本大学 2024。新闻 – 新里程碑有助于推动解决灭绝危机。发布于 17 年 2024 月 XNUMX 日。可在 https://www.unimelb.edu.au/newsroom/news/2024/october/new-milestones-help-drive-solutions-to-extinction-crisis
- 袋狼综合基因组修复研究实验室(TIGRR Lab) https://tigrrlab.science.unimelb.edu.au/the-thylacine/ 和 https://tigrrlab.science.unimelb.edu.au/research/
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