完整的人类基因组序列揭晓

完整 基因组 来自雌性组织来源的细胞系的两条 X 染色体和常染色体的序列已经完成。这其中包括了8% 基因组 2001 年发布的原始草案中缺少的序列。 

完整 基因组 端粒到端粒 (T3.055T) 联盟揭示了整个 2 亿个碱基对的序列。这代表了最大的改进 参考 基因组 Celera Genomics 和 International 于 2001 年发布 以人为本 基因组 测序联盟。那 基因组 序列覆盖了大部分常染色质区域,同时遗漏了异染色质区域或错误表示。这些地区占全国的8% 基因组 这终于被揭晓了。新的 T2T-CHM13 参考1 包括所有 22 个常染色体和 X 染色体的完整序列。这个新的参考序列还纠正了许多错误,并增加了大约 200 亿 bp 的新序列,其中包含 2,226 个基因拷贝,其中 115 个预测为蛋白质编码。  

当前的 GRCh38.p13 参考基因组是两次重大更新的结果,一次是在 2013 年,另一次是在 2019 年对 2001 年 Celera 基因组序列进行的更新。然而,它仍然有 151 亿个未知序列碱基对分布在整个系统中。 基因组,包括着丝粒周围和亚端粒区域、重复、基因和核糖体 DNA (rDNA) 阵列,所有这些都是基本细胞过程所必需的。新参考被命名为 T2T-CHM13,因为它来自 CHM13(完整的葡萄胎)细胞系的 DNA 测序,并由 T2T 联盟进行。该细胞系源自异常受精卵或胎盘组织的过度生长,其中女性似乎怀孕了(假怀孕),因此该序列仅代表女性的两条 X 染色体和常染色体。多种测序技术已投入使用,例如 PacBio、Oxford Nanopore、100X 和 70X Illumina 测序仪等。测序技术的进步使得上面提到的剩下的8%都得到了测序。 

T2T-CHM13 序列的唯一限制是缺少 Y 染色体。 该测序目前正在进行中,使用来自 HG002 细胞系的 DNA,该细胞系具有 46(23 对)XY 核型。 然后使用为纯合 CHM13 基因组开发的相同方法组装序列。 

T2T-CHM13 的可用性作为新的参考 基因组 代表了一项重大突破,将有助于理解异染色质区域的作用,并有助于更详细地了解其对细胞过程的影响。 直到 Y 染色体测序完成,这将作为未来研究了解细胞过程和功能的参考基因组。 

***

案例 

  1. Nurk S、Koren S、Rhie A、Rautiainen M、Bzikadze AV、Mikheenko A 等。一个完整的序列 基因组bioRxiv 2021.05.26.445798;数字编号: https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798 

***

最新动态

脑机接口(BCI):迈向人类与人工智能的融合 

脑机接口(BCI)的临床试验正在进行中……

肿瘤电场疗法(TTFields)获准用于治疗胰腺癌

癌细胞含有带电部分,因此会受到影响……

《欧洲科学》杂志邀请联合创始人

Scientific European (SCIEU) 诚邀您作为联合创始人兼投资者加入我们……

未来环形对撞机(FCC):欧洲核子研究中心理事会审查可行性研究

对未解之谜的探寻(例如,哪些……)

切尔诺贝利真菌作为深空任务抵御宇宙射线的屏障 

1986年,乌克兰切尔诺贝利核电站4号机组……

儿童近视控制:依视路Stellest眼镜镜片授权  

儿童近视(或近视眼)是一种非常普遍的眼部疾病……

资讯订阅

千万不要错过

可持续农业:小农的经济和环境保护

最近的一份报告显示了一项可持续农业倡议...

Omega-3 补充剂可能不会对心脏有益

一项详尽的综合研究表明,Omega-3 补充剂可能不会...

已灭绝猛犸象的古代染色体化石及其完整的三维结构  

具有完整三维结构的古代染色体化石属于...

在法国检测到新的“IHU”变体 (B.1.640.2)

一种名为“IHU”的新变种(一种新的穿山甲血统......

阿尔忒弥斯登月任务:迈向深空人类居住地 

在标志性的阿波罗任务允许...

肠道细菌对抑郁和心理健康的影响

科学家们已经确定了几组不同的细菌...
拉杰夫·索尼
拉杰夫·索尼https://web.archive.org/web/20220523060124/https://www.rajeevsoni.org/publications/
Rajeev Soni 博士 (ORCID ID : 0000-0001-7126-5864) 拥有博士学位。 拥有英国剑桥大学生物技术学士学位,并在斯克里普斯研究所、诺华、诺维信、Ranbaxy、Biocon、Biomerieux 等全球多家机构和跨国公司工作 25 年,并担任美国海军研究实验室的首席研究员在药物发现、分子诊断、蛋白质表达、生物制造和业务发展方面。

脑机接口(BCI):迈向人类与人工智能的融合 

目前正在进行的脑机接口(BCI)临床试验,例如Neuralink的“心灵感应”植入物,旨在建立因未满足的医疗需求而导致的参与者大脑之间的通信连接……

肿瘤电场疗法(TTFields)获准用于治疗胰腺癌

癌细胞含有带电部分,因此会受到电场的影响。将交变电场(TTFields)应用于实体瘤可以选择性地靶向并……

《欧洲科学》杂志邀请联合创始人

Scientific European (SCIEU) 诚邀您作为联合创始人兼投资者加入我们,进行战略投资并积极参与塑造其未来发展方向。Scientific European 是一家总部位于英国的多语种媒体机构……