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B.1.617 SARS COV-2 变种:疫苗的毒力和影响

B.1.617 变种在印度引起了最近的 COVID-19 危机,这与该疾病在人群中的传播增加有关,并对当前可用疫苗的疾病严重程度和有效性提出了重大挑战。 

COVID-19 对整个世界的社会和经济造成了前所未有的破坏。 某些国家也经历了第二波和第三波。 最近印度的病例数有所增加,在过去一个月左右的时间里,现在平均每天有 XNUMX 到 XNUMX 万例。 我们最近分析了印度 COVID 危机可能出了什么问题1. 除了可能导致热潮的社会和文化因素外,病毒本身的变异方式导致出现了比以前更具传染性的变种。 本文介绍了新变种可能如何出现、其引起疾病的可能性和对疫苗有效性的影响,以及可以采取哪些措施来减少其对本地和全球的影响并防止新变种的进一步出现。 

B.1.617 变种 该病毒于 2020 年 40 月首次出现在马哈拉施特拉邦,此后传播到包括英国、斐济和新加坡在内的约 4 个国家。 在过去的几个月里,该菌株已成为整个印度的主要菌株,尤其是在过去 6-1.617 周内,导致感染率大幅上升。 B.3有452个突变,其中484个突变即L681R、E452Q和P484R是关键突变。 L2R 和 EXNUMXQ 都位于受体结合域 (RBD) 中,不仅负责增加与 ACEXNUMX 受体的结合2 导致传染性增加,但也起到抗体中和作用3. P681R 突变显着增加了合胞体的形成,这可能导致发病机制增加。 这种突变导致病毒细胞融合在一起,为病毒复制创造了更大的空间,并使抗体难以破坏它们。 除了 B.1.617,其他两种菌株也可能导致感染率上升, B.1.1.7 在德里和旁遮普邦以及西孟加拉邦的 B.1.618。 B.1.1.7 菌株于 2020 年下半年在英国首次发现,在 RBD 中带有 N501Y 突变,通过增强与 ACE2 受体的结合而导致其传播性增加4. 此外,它还具有其他突变,包括两个缺失。 B.1.1.7 迄今已在全球传播,并已在英国和美国获得 E484R 突变。 已经表明,E484R 突变体对接种辉瑞 mRNA 疫苗的个体的免疫血清的敏感性降低了 6 倍,对恢复期血清的敏感性降低了 11 倍5

只有当病毒感染宿主并进行复制时,才会出现具有附加突变的新病毒株。 这会导致产生更多“更合适”和更具传染性的变异。 这本来可以通过遵守安全协议(例如社交距离、在公共/拥挤的地方适当使用口罩以及遵循基本的个人卫生准则)来防止人类传播来避免的。 B.1.617 的出现和传播表明这些安全指南可能没有得到严格遵守。  

在印度造成严重破坏的 B.1.617 菌株已被世界卫生组织 (WHO) 归类为“关注变种 (VOC)”。 这种分类是基于该变体增加的传染性和严重疾病的传播。  

在使用仓鼠的动物研究中,B.1.617 菌株已被证明比任何其他变体引起更强的炎症6. 此外,该变体通过提高体外细胞系的效率而进入,并且不与 Bamlanivimab 结合,Bamlanivimab 是一种用于 COVID-19 治疗的抗体7. Gupta 及其同事的研究表明,尽管使用辉瑞疫苗接种的个体产生的中和抗体对 B.80 中的某些突变的效力降低了约 1.617%,但这不会使疫苗接种无效3. 这些研究人员还发现,德里的一些已接种 Covishield(牛津-阿斯利康疫苗)的卫生保健工作者再次感染了 B.1.617 菌株。 Stefan Pohlmann 及其同事的其他研究7 使用以前感染过 SARS-CoV-2 的人的血清,发现他们的抗体中和 B.1.617 的效率比以前传播的毒株低 50%。 当对注射过两次辉瑞疫苗的参与者的血清进行测试时,结果表明抗体对 B.67 的效力降低了约 1.617%。 

虽然以上研究表明,B.1.617在较高的传染性和一定程度上逃避中和抗体的基础上,基于血清抗体研究表明B.1.351比其他病毒株具有优势,但体内的真实情况可能会有所不同。产生的大量抗体以及免疫系统的其他部分(如 T 细胞)可能不受菌株突变的影响。 B.XNUMX 变体已经证明了这一点,该变体与中和抗体效力的大幅下降有关,但人体研究表明,这些疫苗在预防严重疾病方面仍然有效。 此外,使用 Covaxin 的研究也表明这种疫苗仍然有效8,尽管 Covaxin 疫苗产生的中和抗体的有效性略有下降。 

所有上述数据表明,需要更多的研究来了解当前疫苗的有效性以及基于可能试图逃避免疫系统以获取自身优势的新毒株的出现的未来版本的产生。 尽管如此,目前的疫苗仍然有效(尽管可能不是 100%),为了预防严重疾病,世界应该争取尽早大规模接种,同时密切关注新出现的毒株,以便采取必要的措施。并尽早采取适当的行动。 这将确保生活早日恢复正常。 

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参考文献:  

  1. Soni R. 2021. 印度的 COVID-19 危机:可能出了什么问题。 科学的欧洲人。 4 年 2021 月 XNUMX 日发布。可在线获取: http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/covid-19-crisis-in-india-what-may-have-gone-wrong/ 
  1. 车里安 . 2021. 在印度马哈拉施特拉邦的第二波 COVID-2 中,SARS-CoV-452 尖峰突变 L484R、E681Q 和 P19R 的趋同演化。 bioRxiv 预印本。 03 年 2021 月 XNUMX 日发布。DOI: https://doi.org/10.1101/2021.04.22.440932   
  1. 费雷拉 I., Datir R.,  2021. SARS-CoV-2 B.1.617 的出现和对疫苗引发的抗体的敏感性。 预印本。 BioRxiv。 09 年 2021 月 XNUMX 日发布。DOI: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.08.443253v1  
  1. Gupta R K. 2021. 关注的 SARS-CoV-2 变体是否会影响疫苗的前景?。 Nat Rev 免疫学。 发布时间:29 年 2021 月 XNUMX 日。DOI: https://doi.org/10.1038/s41577-021-00556-5 
  1. 科利尔 DA 等。 2021. SARS-CoV-2 B.1.1.7 对 mRNA 疫苗引发的抗体的敏感性。 自然 https://doi.org/10.1038/s41586-021-03412-7
  1. 亚达夫 . 2021. SARS CoV-2 变体 B.1.617.1 在仓鼠中的致病性高于 B.1 变体。 bioRxiv 预印本。 05 年 2021 月 XNUMX 日发布。DOI: https://doi.org/10.1101/2021.05.05.442760   
  1. 霍夫曼 . 2021. SARS-CoV-2 变体 B.1.617 对 Bamlanivimab 具有抗性,并逃避感染和疫苗接种引起的抗体。 05 年 2021 月 XNUMX 日发布。 bioRxiv 预印本。 DOI: https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442663   
  1. 亚达夫 . 2021. 用 BBV1.617 疫苗接种者的血清中和研究中的变异 B.152。 发布时间:07 年 2021 月 XNUMX 日。临床。 感染。 迪斯。 DOI: https://doi.org/10.1093/cid/ciab411   

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拉杰夫·索尼
拉杰夫·索尼https://www.RajeevSoni.org/
Rajeev Soni 博士 (ORCID ID : 0000-0001-7126-5864) 拥有博士学位。 拥有英国剑桥大学生物技术学士学位,并在斯克里普斯研究所、诺华、诺维信、Ranbaxy、Biocon、Biomerieux 等全球多家机构和跨国公司工作 25 年,并担任美国海军研究实验室的首席研究员在药物发现、分子诊断、蛋白质表达、生物制造和业务发展方面。

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