结合生物学和计算方法来研究病毒和宿主蛋白质之间的蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI),以识别和重新利用药物以有效治疗 COVID-19 和可能的其他感染.
处理病毒感染的常用策略包括设计抗病毒药物和开发疫苗。 在当前前所未有的危机中,世界正面临着由于 Covid-19 由 SARS-CoV-2 引起 病毒,上述两种方法的结果似乎与提供任何有希望的结果相去甚远。
一组国际研究人员最近 (1) 采用了一种新方法(基于病毒如何与宿主相互作用)来“重新利用”现有药物来识别正在开发的新药,这可以帮助有效对抗 COVID-19 感染。 为了了解 SARS-CoV-2 如何与人类相互作用,研究人员结合使用生物学和计算技术来创建人类蛋白质的“图谱”,病毒蛋白质与这些蛋白质相互作用并用于引起人类感染。 研究人员能够识别出与研究中使用的 300 种病毒蛋白质相互作用的 26 多种人类蛋白质 (2)。 下一步是确定哪些现有药物以及正在开发的药物可能是“改变用途”通过靶向这些人类蛋白质来治疗 COVID-19 感染。
该研究确定了两类可以有效治疗和减少 COVID-19 疾病的药物:蛋白质翻译抑制剂,包括 zotatifin 和 ternatin-4/plitidepsin,以及负责蛋白质调节 Sigma1 和 Sigma 2 受体内部的药物。包括孕酮、PB28、PD-144418、羟氯喹、抗精神病药物氟哌啶醇和氯哌嗪、西拉美新(一种抗抑郁和抗焦虑药物)以及抗组胺药氯马斯汀和氯哌啶。
在蛋白质翻译抑制剂中,对 COVID-19 的体外抗病毒作用最强的是 zotatifin(目前正在进行癌症临床试验)和 ternatin-4/plitidepsin,后者已被 FDA 批准用于治疗多发性骨髓瘤。
在调节 Sigma1 和 Sigma2 受体的药物中,用于治疗精神分裂症的抗精神病药氟哌啶醇对 SARS-CoV-2 具有抗病毒活性。 与 PB28 一样,两种有效的抗组胺药,氯马斯汀和氯帕斯汀,也显示出抗病毒活性。 PB28 显示的抗病毒作用比羟氯喹高约 20 倍。 另一方面,羟氯喹表明,除了靶向 Sigma1 和 -2 受体外,还与称为 hERG 的蛋白质结合,该蛋白质以调节心脏电活动而闻名。 这些结果可能有助于解释与使用羟氯喹及其衍生物作为 COVID-19 潜在疗法相关的可能风险。
尽管上述体外研究产生了令人鼓舞的结果,但“布丁的证据”将取决于这些潜在的药物分子在临床试验中的表现如何,并很快会导致对 COVID-19 的批准治疗。 这项研究的独特之处在于,它扩展了我们对病毒如何与宿主相互作用的基本理解的知识,从而确定了与病毒蛋白相互作用的人类蛋白质,并揭示了在病毒环境中研究可能不明显的化合物。
从这项研究中揭示的这些信息不仅帮助科学家们快速识别出有前途的候选药物以进行临床试验,而且可以用来了解和预测临床上已经发生的治疗的效果,还可以扩展到针对其他药物的药物发现。病毒性疾病和非病毒性疾病。
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参考文献:
1. 巴斯德研究所,2020 年。揭示 SARS-COV-2 如何劫持人类细胞; 指出有潜力对抗 COVID-19 的药物和有助于其传染性增长的药物。 新闻稿 发布于 30 年 2020 月 XNUMX 日。可在线获取: https://www.pasteur.fr/en/research-journal/press-documents/revealing-how-sars-cov-2-hijacks-human-cells-points-drugs-potential-fight-covid-19-and-drug-aids-its 06 年 2020 月 XNUMX 日访问。
2. 戈登,DE 等。 2020. SARS-CoV-2 蛋白相互作用图揭示了药物再利用的目标。 自然 (2020)。 DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-020-2286-9
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